南京牌照不好上的主要原因是 新国标电动自行车申领量过大，导致号牌供应紧缺。具体来说：

新国标实施与需求量增大：

随着电动自行车新国标的实施，市民们纷纷前来上牌，导致车牌需求量急剧增加。

车牌生产厂家新老交替：

在新国标实施的同时，车牌生产厂家也处于新老交替的阶段，这进一步加剧了车牌的紧缺状况。

积极协调与生产：

南京市交管局车管所正在积极协调厂家加紧车牌生产，并预计车牌紧缺的现象将很快得到缓解。

综上所述，南京牌照不好上的主要原因是新国标电动自行车申领量激增以及车牌生产厂家生产能力的暂时不足。目前，车管所正在积极采取措施协调生产，以缓解这一状况。