淘宝会扣除店铺积分的原因主要包括：
客户评价：
如果店铺收到的客户评价中有负面评价，可能会导致积分被扣除。
退款率：
高退款率可能会影响店铺的信誉积分。
物流时效：
发货延迟或物流问题可能会导致积分被扣除。
成交量：
成交量低也可能影响店铺积分。
评价质量：
商品评价的质量不高可能会导致积分减少。
服务质量：
服务质量不佳，如售后服务问题，也可能导致积分被扣除。
商品问题：
售卖假货、商品描述不符或质量问题都可能导致积分扣除。
发货速度：
不能及时发货或长时间无法处理订单会扣除积分。
违规行为：
如恶意刷单、错放商品类别等违规行为也会受到扣分处罚。
投诉举报：
店铺如果收到的投诉举报达到一定数量，也可能被扣除积分。
淘宝的扣分制度是为了规范电商市场秩序、保护消费者权益和维护电商生态环境。积分被扣除到一定程度时，店铺可能会面临封禁等处罚。
